Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 YGL177WYGL177W 348 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 ERG25YGR060W 930 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 ASG7YJL170C 630 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 CDC123YLR215C 1083 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YLR365WYLR365W 333 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YMR099CYMR099C 894 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 FYV6YNL133C 522 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 HSP10YOR020C 321 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 RRG7YOR305W 729 nt2.59□□□□□ -1.99
SHQ1P40486 OSW7YFR039C 1533 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 MMS1YPR164W 4224 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 YCR064CYCR064C 411 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 MEI4YER044C-A 1227 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 YGR053CYGR053C 852 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 TMA10YLR327C 261 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 DLT1YMR126C 1029 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 TFB6YOR352W 1032 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 RRG8YPR116W 834 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 PEX5YDR244W 1839 nt2.58□□□□□ -2
SHQ1P40486 YOL057WYOL057W 2136 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 SPF1YEL031W 3648 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 RPL13AYDL082W 600 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 YFH7YFR007W 1062 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 HTD2YHR067W 843 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 MCR1YKL150W 909 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 BOS1YLR078C 735 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 AIM32YML050W 936 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 YML090WYML090W 387 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 KTI11YBL071W-A 249 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 MPP6YNR024W 561 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 ACM1YPL267W 630 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 KAR4YCL055W 1008 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 URB2YJR041C 3525 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 DNL4YOR005C 2835 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 STN1YDR082W 1485 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 IRA2YOL081W 9240 nt2.57□□□□□ -2
SHQ1P40486 ISW1YBR245C 3390 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 DIG2YDR480W 972 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 PAU14YIL176C 363 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 PAU1YJL223C 363 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 VPS25YJR102C 609 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 CCE1YKL011C 1062 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 KHA1YJL094C 2622 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 TOP2YNL088W 4287 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 SEN54YPL083C 1404 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 YDR061WYDR061W 1620 nt2.56□□□□□ -2
SHQ1P40486 FIR1YER032W 2631 nt2.55□□□□□ -2
SHQ1P40486 ALB1YJL122W 528 nt2.55□□□□□ -2
SHQ1P40486 YJL169WYJL169W 369 nt2.55□□□□□ -2
SHQ1P40486 SGM1YJR134C 2124 nt2.55□□□□□ -2
SHQ1P40486 YKL070WYKL070W 510 nt2.55□□□□□ -2
SHQ1P40486 PRM6YML047C 1059 nt2.55□□□□□ -2
SHQ1P40486 YOR283WYOR283W 693 nt2.55□□□□□ -2
SHQ1P40486 SYO1YDL063C 1863 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 RLI1YDR091C 1827 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 SAD1YFR005C 1347 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 DPP1YDR284C 870 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 HYM1YKL189W 1200 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 RPL6BYLR448W 531 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 END3YNL084C 1050 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 GCY1YOR120W 939 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 AIM4YBR194W 372 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 MUB1YMR100W 1863 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 MDM36YPR083W 1740 nt2.54□□□□□ -2
SHQ1P40486 GCV2YMR189W 3105 nt2.53□□□□□ -2
SHQ1P40486 TMN3YER113C 2121 nt2.53□□□□□ -2
SHQ1P40486 RSM24YDR175C 960 nt2.53□□□□□ -2
SHQ1P40486 PEX4YGR133W 552 nt2.53□□□□□ -2
SHQ1P40486 PSF2YJL072C 642 nt2.53□□□□□ -2
SHQ1P40486 YJR056CYJR056C 711 nt2.53□□□□□ -2
SHQ1P40486 PDR17YNL264C 1053 nt2.53□□□□□ -2
SHQ1P40486 JID1YPR061C 906 nt2.53□□□□□ -2
SHQ1P40486 YEF3YLR249W 3135 nt2.53□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 REV3YPL167C 4515 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YKU80YMR106C 1890 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SCP160YJL080C 3669 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SCD5YOR329C 2619 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YCR016WYCR016W 873 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YPD1YDL235C 504 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 LSM4YER112W 564 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 ERV1YGR029W 570 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 snR35snR35 204 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SNX41YDR425W 1878 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SMY2YBR172C 2223 nt2.52□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 GCD10YNL062C 1437 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YNL193WYNL193W 1677 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 SUL1YBR294W 2580 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YEL010WYEL010W 351 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 ADI1YMR009W 540 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 ALG14YBR070C 714 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 snR44snR44 211 nt2.51□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 DNF1YER166W 4716 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 RIM13YMR154C 2184 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.5□□□□□ -2.01
SHQ1P40486 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.5□□□□□ -2.01
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