Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPARGP37231 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPARGP37231 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PPARGP37231 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPARGP37231 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPARGP37231 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPARGP37231 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPARGP37231 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPARGP37231 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPARGP37231 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPARGP37231 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PPARGP37231 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms