Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TGFBR1P36897 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGFBR1P36897 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms