Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPA4P34932 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms