Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC3AP31941 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC3AP31941 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms