Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC27P30260 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC27P30260 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC27P30260 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC27P30260 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC27P30260 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC27P30260 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC27P30260 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms