Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK1P29120 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK1P29120 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms