Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAP3P28838 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAP3P28838 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAP3P28838 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAP3P28838 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAP3P28838 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAP3P28838 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
LAP3P28838 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LAP3P28838 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAP3P28838 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LAP3P28838 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAP3P28838 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms