Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB2P26583 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB2P26583 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms