Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMO2P25791 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO2P25791 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO2P25791 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO2P25791 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO2P25791 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMO2P25791 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMO2P25791 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO2P25791 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO2P25791 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO2P25791 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO2P25791 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO2P25791 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO2P25791 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO2P25791 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO2P25791 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO2P25791 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO2P25791 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms