Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF4BP23588 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4BP23588 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms