Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRGP23470 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRGP23470 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
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