Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALB2P22676 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CALB2P22676 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALB2P22676 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALB2P22676 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALB2P22676 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALB2P22676 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CALB2P22676 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CALB2P22676 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALB2P22676 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALB2P22676 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms