Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGFR3P22607 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms