Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN1P17600 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN1P17600 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN1P17600 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN1P17600 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN1P17600 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN1P17600 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN1P17600 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN1P17600 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYN1P17600 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYN1P17600 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYN1P17600 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYN1P17600 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN1P17600 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN1P17600 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN1P17600 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN1P17600 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN1P17600 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN1P17600 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN1P17600 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms