Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCL3L1P16619 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3L1P16619 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms