Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDGFRAP16234 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDGFRAP16234 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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