Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREB1P16220 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREB1P16220 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREB1P16220 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREB1P16220 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREB1P16220 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREB1P16220 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREB1P16220 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CREB1P16220 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CREB1P16220 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CREB1P16220 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CREB1P16220 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CREB1P16220 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CREB1P16220 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CREB1P16220 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CREB1P16220 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CREB1P16220 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms