Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSF2RAP15509 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2RAP15509 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms