Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM27P14373 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM27P14373 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms