Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCSHP14314 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCSHP14314 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms