Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFTRP13569 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFTRP13569 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFTRP13569 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFTRP13569 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFTRP13569 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFTRP13569 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFTRP13569 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFTRP13569 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFTRP13569 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFTRP13569 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFTRP13569 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFTRP13569 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFTRP13569 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
CFTRP13569 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFTRP13569 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFTRP13569 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFTRP13569 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFTRP13569 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFTRP13569 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CFTRP13569 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.38
CFTRP13569 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFTRP13569 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CFTRP13569 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFTRP13569 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFTRP13569 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFTRP13569 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFTRP13569 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CFTRP13569 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CFTRP13569 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CFTRP13569 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFTRP13569 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms