Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCG2P13521 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG2P13521 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG2P13521 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG2P13521 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG2P13521 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCG2P13521 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCG2P13521 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCG2P13521 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCG2P13521 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCG2P13521 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG2P13521 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms