Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ITGAMP11215 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms