Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GLI3P10071 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI3P10071 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI3P10071 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI3P10071 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI3P10071 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI3P10071 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GLI3P10071 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI3P10071 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI3P10071 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI3P10071 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI3P10071 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI3P10071 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI3P10071 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI3P10071 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GLI3P10071 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GLI3P10071 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GLI3P10071 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI3P10071 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI3P10071 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI3P10071 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI3P10071 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI3P10071 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GLI3P10071 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GLI3P10071 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms