Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM200BP0CF97 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM200BP0CF97 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms