Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCCAP05165 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCCAP05165 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCCAP05165 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCCAP05165 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCCAP05165 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCCAP05165 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCCAP05165 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCCAP05165 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCCAP05165 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCCAP05165 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCCAP05165 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCCAP05165 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCCAP05165 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCCAP05165 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCCAP05165 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCCAP05165 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCCAP05165 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCCAP05165 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCCAP05165 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCCAP05165 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms