Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTNP04004 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTNP04004 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTNP04004 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTNP04004 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTNP04004 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTNP04004 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTNP04004 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTNP04004 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTNP04004 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTNP04004 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTNP04004 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTNP04004 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTNP04004 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTNP04004 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTNP04004 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTNP04004 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTNP04004 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTNP04004 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTNP04004 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTNP04004 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTNP04004 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms