Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOP3BO95985 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TOP3BO95985 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TOP3BO95985 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TOP3BO95985 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TOP3BO95985 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP3BO95985 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms