Protein–RNA interactions for Protein: O95954

FTCD, Formimidoyltransferase-cyclodeaminase, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTCDO95954 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FTCDO95954 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FTCDO95954 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FTCDO95954 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FTCDO95954 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FTCDO95954 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FTCDO95954 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FTCDO95954 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms