Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYF2O95926 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYF2O95926 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYF2O95926 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYF2O95926 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYF2O95926 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYF2O95926 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SYF2O95926 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYF2O95926 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYF2O95926 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYF2O95926 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYF2O95926 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYF2O95926 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYF2O95926 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYF2O95926 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms