Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TIPRLO75663 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TIPRLO75663 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms