Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF253O75346 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF253O75346 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF253O75346 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF253O75346 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF253O75346 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF253O75346 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF253O75346 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms