Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMARCA5O60264 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMARCA5O60264 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms