Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SART1O43290 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SART1O43290 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SART1O43290 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SART1O43290 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SART1O43290 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SART1O43290 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SART1O43290 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SART1O43290 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SART1O43290 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SART1O43290 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SART1O43290 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SART1O43290 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SART1O43290 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SART1O43290 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SART1O43290 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms