Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD3O43242 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms