Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DYNC1LI2O43237 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms