Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SETD1AO15047 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1AO15047 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1AO15047 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms