Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA3EO15041 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3EO15041 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms