Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASKO14936 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASKO14936 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASKO14936 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASKO14936 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASKO14936 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASKO14936 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASKO14936 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASKO14936 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASKO14936 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASKO14936 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASKO14936 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms