Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
IFIT3O14879 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms