Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBAG9O00559 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBAG9O00559 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms