Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF10AO00220 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF10AO00220 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms