Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IQCJ-SCHIP1C9J366 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms