Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf47A7E2U8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf47A7E2U8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms