Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSDA5PKW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSDA5PKW4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms