Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP5LA4QPB2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP5LA4QPB2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms