Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRAMEF22A3QJZ6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms