Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSC5DA1L4H1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSC5DA1L4H1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms