Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX49Q9Y6V7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX49Q9Y6V7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms